Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ercc8Q8CFD5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ercc8Q8CFD5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ercc8Q8CFD5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ercc8Q8CFD5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ercc8Q8CFD5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ercc8Q8CFD5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Ercc8Q8CFD5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Ercc8Q8CFD5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ercc8Q8CFD5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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