Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot2Q8C5L3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms