Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVM7

Als2cr12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2cr12Q8BVM7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Als2cr12Q8BVM7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms