Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ScocQ78YZ6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms