Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR4

Ppp2r2b, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r2bQ6ZWR4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms