Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Szrd1Q6NXN1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms