Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CilpQ66K08 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms