Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nptx1Q62443 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms