Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ItgaeQ60677 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ItgaeQ60677 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms