Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Trp53i11Q4QQM4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trp53i11Q4QQM4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trp53i11Q4QQM4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trp53i11Q4QQM4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trp53i11Q4QQM4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Trp53i11Q4QQM4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trp53i11Q4QQM4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trp53i11Q4QQM4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Trp53i11Q4QQM4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Trp53i11Q4QQM4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Trp53i11Q4QQM4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trp53i11Q4QQM4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trp53i11Q4QQM4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trp53i11Q4QQM4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trp53i11Q4QQM4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trp53i11Q4QQM4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Trp53i11Q4QQM4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trp53i11Q4QQM4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trp53i11Q4QQM4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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Trp53i11Q4QQM4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trp53i11Q4QQM4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trp53i11Q4QQM4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trp53i11Q4QQM4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trp53i11Q4QQM4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trp53i11Q4QQM4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trp53i11Q4QQM4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trp53i11Q4QQM4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trp53i11Q4QQM4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trp53i11Q4QQM4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trp53i11Q4QQM4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trp53i11Q4QQM4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trp53i11Q4QQM4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trp53i11Q4QQM4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trp53i11Q4QQM4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trp53i11Q4QQM4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trp53i11Q4QQM4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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