Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms