Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc28Q3TX51 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc28Q3TX51 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms