Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc10Q3TLI0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms