Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL24A1Q17RW2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
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