Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Traf3ip1Q149C2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Traf3ip1Q149C2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Traf3ip1Q149C2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Traf3ip1Q149C2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Traf3ip1Q149C2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Traf3ip1Q149C2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3ip1Q149C2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms