Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scg2Q03517 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms