Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra1P97785 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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