Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb1P70662 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms