Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Stra8P70278 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stra8P70278 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stra8P70278 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stra8P70278 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stra8P70278 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stra8P70278 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stra8P70278 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stra8P70278 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stra8P70278 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stra8P70278 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stra8P70278 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Stra8P70278 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Stra8P70278 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stra8P70278 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms