Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lire1P11260 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lire1P11260 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lire1P11260 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lire1P11260 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms