Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm21310J3QQ23 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm21310J3QQ23 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm21310J3QQ23 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm21310J3QQ23 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm21310J3QQ23 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm21310J3QQ23 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm21310J3QQ23 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Gm21310J3QQ23 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm21310J3QQ23 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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