Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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