Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim30cD3YVI9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms