Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms