Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCNX2A6NKB5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms