Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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