Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y8

Plpbp, Pyridoxal phosphate homeostasis protein, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlpbpQ9Z2Y8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PlpbpQ9Z2Y8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PlpbpQ9Z2Y8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PlpbpQ9Z2Y8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PlpbpQ9Z2Y8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PlpbpQ9Z2Y8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PlpbpQ9Z2Y8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PlpbpQ9Z2Y8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PlpbpQ9Z2Y8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PlpbpQ9Z2Y8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms