Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Knop1Q9Z2Q2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Knop1Q9Z2Q2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Knop1Q9Z2Q2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Knop1Q9Z2Q2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Knop1Q9Z2Q2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Knop1Q9Z2Q2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Knop1Q9Z2Q2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Knop1Q9Z2Q2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Knop1Q9Z2Q2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Knop1Q9Z2Q2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Knop1Q9Z2Q2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Knop1Q9Z2Q2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Knop1Q9Z2Q2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Knop1Q9Z2Q2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Knop1Q9Z2Q2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Knop1Q9Z2Q2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Knop1Q9Z2Q2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Knop1Q9Z2Q2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Knop1Q9Z2Q2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Knop1Q9Z2Q2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Knop1Q9Z2Q2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Knop1Q9Z2Q2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Knop1Q9Z2Q2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Knop1Q9Z2Q2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Knop1Q9Z2Q2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Knop1Q9Z2Q2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Knop1Q9Z2Q2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Knop1Q9Z2Q2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Knop1Q9Z2Q2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Knop1Q9Z2Q2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Knop1Q9Z2Q2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Knop1Q9Z2Q2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Knop1Q9Z2Q2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Knop1Q9Z2Q2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Knop1Q9Z2Q2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Knop1Q9Z2Q2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Knop1Q9Z2Q2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Knop1Q9Z2Q2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Knop1Q9Z2Q2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Knop1Q9Z2Q2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Knop1Q9Z2Q2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Knop1Q9Z2Q2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Knop1Q9Z2Q2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Knop1Q9Z2Q2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Knop1Q9Z2Q2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Knop1Q9Z2Q2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Knop1Q9Z2Q2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Knop1Q9Z2Q2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Knop1Q9Z2Q2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Knop1Q9Z2Q2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Knop1Q9Z2Q2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Knop1Q9Z2Q2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Knop1Q9Z2Q2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Knop1Q9Z2Q2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Knop1Q9Z2Q2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Knop1Q9Z2Q2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Knop1Q9Z2Q2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Knop1Q9Z2Q2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Knop1Q9Z2Q2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Knop1Q9Z2Q2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Knop1Q9Z2Q2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Knop1Q9Z2Q2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Knop1Q9Z2Q2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Knop1Q9Z2Q2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Knop1Q9Z2Q2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Knop1Q9Z2Q2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Knop1Q9Z2Q2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Knop1Q9Z2Q2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Knop1Q9Z2Q2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Knop1Q9Z2Q2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Knop1Q9Z2Q2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Knop1Q9Z2Q2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Knop1Q9Z2Q2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Knop1Q9Z2Q2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Knop1Q9Z2Q2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Knop1Q9Z2Q2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Knop1Q9Z2Q2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Knop1Q9Z2Q2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Knop1Q9Z2Q2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Knop1Q9Z2Q2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Knop1Q9Z2Q2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Knop1Q9Z2Q2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Knop1Q9Z2Q2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Knop1Q9Z2Q2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Knop1Q9Z2Q2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Knop1Q9Z2Q2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Knop1Q9Z2Q2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Knop1Q9Z2Q2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Knop1Q9Z2Q2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Knop1Q9Z2Q2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Knop1Q9Z2Q2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Knop1Q9Z2Q2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Knop1Q9Z2Q2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Knop1Q9Z2Q2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Knop1Q9Z2Q2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Knop1Q9Z2Q2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Knop1Q9Z2Q2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms