Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E4

Ppp1r17, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 17, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r17Q9Z2E4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r17Q9Z2E4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r17Q9Z2E4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r17Q9Z2E4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r17Q9Z2E4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r17Q9Z2E4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r17Q9Z2E4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r17Q9Z2E4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r17Q9Z2E4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r17Q9Z2E4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r17Q9Z2E4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r17Q9Z2E4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r17Q9Z2E4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r17Q9Z2E4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r17Q9Z2E4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r17Q9Z2E4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r17Q9Z2E4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r17Q9Z2E4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r17Q9Z2E4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r17Q9Z2E4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r17Q9Z2E4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r17Q9Z2E4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r17Q9Z2E4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r17Q9Z2E4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ppp1r17Q9Z2E4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp1r17Q9Z2E4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp1r17Q9Z2E4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r17Q9Z2E4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r17Q9Z2E4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r17Q9Z2E4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r17Q9Z2E4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r17Q9Z2E4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r17Q9Z2E4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r17Q9Z2E4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r17Q9Z2E4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r17Q9Z2E4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r17Q9Z2E4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r17Q9Z2E4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp1r17Q9Z2E4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp1r17Q9Z2E4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ppp1r17Q9Z2E4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppp1r17Q9Z2E4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppp1r17Q9Z2E4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppp1r17Q9Z2E4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp1r17Q9Z2E4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp1r17Q9Z2E4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp1r17Q9Z2E4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp1r17Q9Z2E4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp1r17Q9Z2E4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp1r17Q9Z2E4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp1r17Q9Z2E4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp1r17Q9Z2E4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppp1r17Q9Z2E4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppp1r17Q9Z2E4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppp1r17Q9Z2E4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppp1r17Q9Z2E4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppp1r17Q9Z2E4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppp1r17Q9Z2E4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppp1r17Q9Z2E4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppp1r17Q9Z2E4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppp1r17Q9Z2E4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppp1r17Q9Z2E4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppp1r17Q9Z2E4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppp1r17Q9Z2E4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppp1r17Q9Z2E4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppp1r17Q9Z2E4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppp1r17Q9Z2E4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppp1r17Q9Z2E4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppp1r17Q9Z2E4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppp1r17Q9Z2E4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppp1r17Q9Z2E4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppp1r17Q9Z2E4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppp1r17Q9Z2E4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppp1r17Q9Z2E4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppp1r17Q9Z2E4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppp1r17Q9Z2E4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppp1r17Q9Z2E4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppp1r17Q9Z2E4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppp1r17Q9Z2E4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppp1r17Q9Z2E4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppp1r17Q9Z2E4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppp1r17Q9Z2E4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppp1r17Q9Z2E4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppp1r17Q9Z2E4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppp1r17Q9Z2E4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppp1r17Q9Z2E4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppp1r17Q9Z2E4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ppp1r17Q9Z2E4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppp1r17Q9Z2E4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppp1r17Q9Z2E4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppp1r17Q9Z2E4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms