Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VarsQ9Z1Q9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VarsQ9Z1Q9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VarsQ9Z1Q9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VarsQ9Z1Q9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VarsQ9Z1Q9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VarsQ9Z1Q9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VarsQ9Z1Q9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VarsQ9Z1Q9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VarsQ9Z1Q9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VarsQ9Z1Q9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VarsQ9Z1Q9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VarsQ9Z1Q9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VarsQ9Z1Q9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VarsQ9Z1Q9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VarsQ9Z1Q9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VarsQ9Z1Q9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VarsQ9Z1Q9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VarsQ9Z1Q9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VarsQ9Z1Q9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VarsQ9Z1Q9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VarsQ9Z1Q9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VarsQ9Z1Q9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VarsQ9Z1Q9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VarsQ9Z1Q9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VarsQ9Z1Q9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VarsQ9Z1Q9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VarsQ9Z1Q9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VarsQ9Z1Q9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VarsQ9Z1Q9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VarsQ9Z1Q9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VarsQ9Z1Q9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VarsQ9Z1Q9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VarsQ9Z1Q9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VarsQ9Z1Q9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VarsQ9Z1Q9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VarsQ9Z1Q9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VarsQ9Z1Q9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VarsQ9Z1Q9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VarsQ9Z1Q9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VarsQ9Z1Q9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VarsQ9Z1Q9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VarsQ9Z1Q9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VarsQ9Z1Q9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VarsQ9Z1Q9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VarsQ9Z1Q9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VarsQ9Z1Q9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VarsQ9Z1Q9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VarsQ9Z1Q9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VarsQ9Z1Q9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VarsQ9Z1Q9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VarsQ9Z1Q9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VarsQ9Z1Q9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VarsQ9Z1Q9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VarsQ9Z1Q9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VarsQ9Z1Q9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VarsQ9Z1Q9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VarsQ9Z1Q9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VarsQ9Z1Q9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VarsQ9Z1Q9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VarsQ9Z1Q9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VarsQ9Z1Q9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VarsQ9Z1Q9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VarsQ9Z1Q9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VarsQ9Z1Q9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VarsQ9Z1Q9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms