Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syngr4Q9Z1L2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngr4Q9Z1L2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngr4Q9Z1L2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngr4Q9Z1L2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngr4Q9Z1L2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngr4Q9Z1L2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syngr4Q9Z1L2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syngr4Q9Z1L2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syngr4Q9Z1L2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syngr4Q9Z1L2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syngr4Q9Z1L2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngr4Q9Z1L2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngr4Q9Z1L2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syngr4Q9Z1L2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syngr4Q9Z1L2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syngr4Q9Z1L2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syngr4Q9Z1L2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngr4Q9Z1L2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngr4Q9Z1L2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngr4Q9Z1L2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngr4Q9Z1L2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngr4Q9Z1L2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngr4Q9Z1L2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syngr4Q9Z1L2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syngr4Q9Z1L2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syngr4Q9Z1L2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syngr4Q9Z1L2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syngr4Q9Z1L2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syngr4Q9Z1L2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syngr4Q9Z1L2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Syngr4Q9Z1L2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Syngr4Q9Z1L2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngr4Q9Z1L2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngr4Q9Z1L2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngr4Q9Z1L2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngr4Q9Z1L2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngr4Q9Z1L2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngr4Q9Z1L2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syngr4Q9Z1L2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syngr4Q9Z1L2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syngr4Q9Z1L2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Syngr4Q9Z1L2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syngr4Q9Z1L2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syngr4Q9Z1L2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syngr4Q9Z1L2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Syngr4Q9Z1L2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syngr4Q9Z1L2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syngr4Q9Z1L2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngr4Q9Z1L2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngr4Q9Z1L2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngr4Q9Z1L2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngr4Q9Z1L2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngr4Q9Z1L2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngr4Q9Z1L2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngr4Q9Z1L2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngr4Q9Z1L2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngr4Q9Z1L2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngr4Q9Z1L2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngr4Q9Z1L2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngr4Q9Z1L2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngr4Q9Z1L2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngr4Q9Z1L2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngr4Q9Z1L2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngr4Q9Z1L2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngr4Q9Z1L2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngr4Q9Z1L2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngr4Q9Z1L2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngr4Q9Z1L2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syngr4Q9Z1L2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syngr4Q9Z1L2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syngr4Q9Z1L2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngr4Q9Z1L2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngr4Q9Z1L2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngr4Q9Z1L2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngr4Q9Z1L2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngr4Q9Z1L2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngr4Q9Z1L2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syngr4Q9Z1L2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syngr4Q9Z1L2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syngr4Q9Z1L2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syngr4Q9Z1L2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syngr4Q9Z1L2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syngr4Q9Z1L2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syngr4Q9Z1L2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syngr4Q9Z1L2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syngr4Q9Z1L2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syngr4Q9Z1L2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syngr4Q9Z1L2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Syngr4Q9Z1L2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syngr4Q9Z1L2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syngr4Q9Z1L2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syngr4Q9Z1L2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms