Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpne6Q9Z140 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cpne6Q9Z140 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpne6Q9Z140 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpne6Q9Z140 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpne6Q9Z140 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpne6Q9Z140 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpne6Q9Z140 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpne6Q9Z140 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpne6Q9Z140 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpne6Q9Z140 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpne6Q9Z140 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpne6Q9Z140 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpne6Q9Z140 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpne6Q9Z140 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpne6Q9Z140 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpne6Q9Z140 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpne6Q9Z140 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpne6Q9Z140 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpne6Q9Z140 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpne6Q9Z140 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpne6Q9Z140 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpne6Q9Z140 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpne6Q9Z140 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpne6Q9Z140 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpne6Q9Z140 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpne6Q9Z140 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpne6Q9Z140 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpne6Q9Z140 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpne6Q9Z140 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpne6Q9Z140 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpne6Q9Z140 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpne6Q9Z140 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpne6Q9Z140 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpne6Q9Z140 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpne6Q9Z140 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpne6Q9Z140 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne6Q9Z140 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne6Q9Z140 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne6Q9Z140 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne6Q9Z140 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne6Q9Z140 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne6Q9Z140 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne6Q9Z140 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpne6Q9Z140 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpne6Q9Z140 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpne6Q9Z140 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpne6Q9Z140 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpne6Q9Z140 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpne6Q9Z140 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpne6Q9Z140 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpne6Q9Z140 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpne6Q9Z140 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpne6Q9Z140 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpne6Q9Z140 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpne6Q9Z140 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpne6Q9Z140 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne6Q9Z140 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne6Q9Z140 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne6Q9Z140 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne6Q9Z140 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne6Q9Z140 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne6Q9Z140 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne6Q9Z140 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne6Q9Z140 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne6Q9Z140 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpne6Q9Z140 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpne6Q9Z140 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpne6Q9Z140 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpne6Q9Z140 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpne6Q9Z140 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpne6Q9Z140 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne6Q9Z140 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne6Q9Z140 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne6Q9Z140 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne6Q9Z140 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpne6Q9Z140 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpne6Q9Z140 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpne6Q9Z140 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne6Q9Z140 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne6Q9Z140 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne6Q9Z140 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne6Q9Z140 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne6Q9Z140 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne6Q9Z140 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpne6Q9Z140 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpne6Q9Z140 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpne6Q9Z140 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpne6Q9Z140 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpne6Q9Z140 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpne6Q9Z140 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpne6Q9Z140 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpne6Q9Z140 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpne6Q9Z140 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cpne6Q9Z140 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpne6Q9Z140 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpne6Q9Z140 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpne6Q9Z140 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpne6Q9Z140 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpne6Q9Z140 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms