Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clip2Q9Z0H8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clip2Q9Z0H8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Clip2Q9Z0H8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Clip2Q9Z0H8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Clip2Q9Z0H8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clip2Q9Z0H8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clip2Q9Z0H8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Clip2Q9Z0H8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clip2Q9Z0H8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clip2Q9Z0H8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clip2Q9Z0H8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Clip2Q9Z0H8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clip2Q9Z0H8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Clip2Q9Z0H8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clip2Q9Z0H8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Clip2Q9Z0H8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Clip2Q9Z0H8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Clip2Q9Z0H8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clip2Q9Z0H8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Clip2Q9Z0H8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Clip2Q9Z0H8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Clip2Q9Z0H8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Clip2Q9Z0H8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clip2Q9Z0H8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clip2Q9Z0H8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clip2Q9Z0H8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clip2Q9Z0H8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clip2Q9Z0H8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clip2Q9Z0H8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Clip2Q9Z0H8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Clip2Q9Z0H8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Clip2Q9Z0H8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clip2Q9Z0H8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Clip2Q9Z0H8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clip2Q9Z0H8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clip2Q9Z0H8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clip2Q9Z0H8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clip2Q9Z0H8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clip2Q9Z0H8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clip2Q9Z0H8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clip2Q9Z0H8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clip2Q9Z0H8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clip2Q9Z0H8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clip2Q9Z0H8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clip2Q9Z0H8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clip2Q9Z0H8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clip2Q9Z0H8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clip2Q9Z0H8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clip2Q9Z0H8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clip2Q9Z0H8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clip2Q9Z0H8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clip2Q9Z0H8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Clip2Q9Z0H8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clip2Q9Z0H8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Clip2Q9Z0H8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clip2Q9Z0H8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clip2Q9Z0H8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clip2Q9Z0H8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clip2Q9Z0H8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clip2Q9Z0H8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clip2Q9Z0H8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clip2Q9Z0H8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clip2Q9Z0H8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Clip2Q9Z0H8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clip2Q9Z0H8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Clip2Q9Z0H8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clip2Q9Z0H8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clip2Q9Z0H8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clip2Q9Z0H8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clip2Q9Z0H8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clip2Q9Z0H8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clip2Q9Z0H8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clip2Q9Z0H8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clip2Q9Z0H8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clip2Q9Z0H8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clip2Q9Z0H8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clip2Q9Z0H8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clip2Q9Z0H8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clip2Q9Z0H8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clip2Q9Z0H8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clip2Q9Z0H8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clip2Q9Z0H8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Clip2Q9Z0H8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Clip2Q9Z0H8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Clip2Q9Z0H8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clip2Q9Z0H8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clip2Q9Z0H8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clip2Q9Z0H8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clip2Q9Z0H8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clip2Q9Z0H8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clip2Q9Z0H8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Clip2Q9Z0H8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clip2Q9Z0H8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clip2Q9Z0H8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Clip2Q9Z0H8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clip2Q9Z0H8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clip2Q9Z0H8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clip2Q9Z0H8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clip2Q9Z0H8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms