Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cldn3Q9Z0G9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cldn3Q9Z0G9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cldn3Q9Z0G9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cldn3Q9Z0G9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cldn3Q9Z0G9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cldn3Q9Z0G9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cldn3Q9Z0G9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldn3Q9Z0G9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldn3Q9Z0G9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldn3Q9Z0G9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldn3Q9Z0G9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldn3Q9Z0G9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cldn3Q9Z0G9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cldn3Q9Z0G9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cldn3Q9Z0G9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cldn3Q9Z0G9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cldn3Q9Z0G9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cldn3Q9Z0G9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cldn3Q9Z0G9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cldn3Q9Z0G9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cldn3Q9Z0G9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cldn3Q9Z0G9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cldn3Q9Z0G9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn3Q9Z0G9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn3Q9Z0G9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldn3Q9Z0G9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldn3Q9Z0G9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cldn3Q9Z0G9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cldn3Q9Z0G9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cldn3Q9Z0G9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cldn3Q9Z0G9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cldn3Q9Z0G9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cldn3Q9Z0G9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cldn3Q9Z0G9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cldn3Q9Z0G9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cldn3Q9Z0G9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cldn3Q9Z0G9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cldn3Q9Z0G9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cldn3Q9Z0G9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldn3Q9Z0G9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldn3Q9Z0G9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldn3Q9Z0G9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cldn3Q9Z0G9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cldn3Q9Z0G9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cldn3Q9Z0G9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cldn3Q9Z0G9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cldn3Q9Z0G9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cldn3Q9Z0G9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cldn3Q9Z0G9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cldn3Q9Z0G9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cldn3Q9Z0G9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cldn3Q9Z0G9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cldn3Q9Z0G9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cldn3Q9Z0G9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cldn3Q9Z0G9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cldn3Q9Z0G9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cldn3Q9Z0G9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cldn3Q9Z0G9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cldn3Q9Z0G9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cldn3Q9Z0G9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cldn3Q9Z0G9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn3Q9Z0G9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn3Q9Z0G9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn3Q9Z0G9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn3Q9Z0G9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn3Q9Z0G9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn3Q9Z0G9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn3Q9Z0G9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn3Q9Z0G9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn3Q9Z0G9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cldn3Q9Z0G9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cldn3Q9Z0G9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cldn3Q9Z0G9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cldn3Q9Z0G9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cldn3Q9Z0G9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cldn3Q9Z0G9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cldn3Q9Z0G9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cldn3Q9Z0G9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cldn3Q9Z0G9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cldn3Q9Z0G9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cldn3Q9Z0G9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cldn3Q9Z0G9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cldn3Q9Z0G9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cldn3Q9Z0G9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cldn3Q9Z0G9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cldn3Q9Z0G9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cldn3Q9Z0G9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cldn3Q9Z0G9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cldn3Q9Z0G9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cldn3Q9Z0G9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cldn3Q9Z0G9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cldn3Q9Z0G9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cldn3Q9Z0G9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cldn3Q9Z0G9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cldn3Q9Z0G9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cldn3Q9Z0G9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cldn3Q9Z0G9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cldn3Q9Z0G9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn3Q9Z0G9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145 ms