Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pacsin2Q9WVE8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pacsin2Q9WVE8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pacsin2Q9WVE8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pacsin2Q9WVE8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pacsin2Q9WVE8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pacsin2Q9WVE8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pacsin2Q9WVE8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pacsin2Q9WVE8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pacsin2Q9WVE8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pacsin2Q9WVE8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pacsin2Q9WVE8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pacsin2Q9WVE8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pacsin2Q9WVE8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pacsin2Q9WVE8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pacsin2Q9WVE8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pacsin2Q9WVE8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pacsin2Q9WVE8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pacsin2Q9WVE8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pacsin2Q9WVE8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pacsin2Q9WVE8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pacsin2Q9WVE8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pacsin2Q9WVE8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pacsin2Q9WVE8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pacsin2Q9WVE8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pacsin2Q9WVE8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pacsin2Q9WVE8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pacsin2Q9WVE8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pacsin2Q9WVE8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pacsin2Q9WVE8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pacsin2Q9WVE8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pacsin2Q9WVE8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pacsin2Q9WVE8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pacsin2Q9WVE8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pacsin2Q9WVE8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pacsin2Q9WVE8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pacsin2Q9WVE8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pacsin2Q9WVE8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pacsin2Q9WVE8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pacsin2Q9WVE8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pacsin2Q9WVE8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pacsin2Q9WVE8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pacsin2Q9WVE8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pacsin2Q9WVE8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pacsin2Q9WVE8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pacsin2Q9WVE8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pacsin2Q9WVE8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pacsin2Q9WVE8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pacsin2Q9WVE8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pacsin2Q9WVE8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pacsin2Q9WVE8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pacsin2Q9WVE8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pacsin2Q9WVE8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pacsin2Q9WVE8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pacsin2Q9WVE8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pacsin2Q9WVE8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pacsin2Q9WVE8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pacsin2Q9WVE8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pacsin2Q9WVE8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pacsin2Q9WVE8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pacsin2Q9WVE8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pacsin2Q9WVE8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pacsin2Q9WVE8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pacsin2Q9WVE8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pacsin2Q9WVE8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pacsin2Q9WVE8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pacsin2Q9WVE8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pacsin2Q9WVE8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pacsin2Q9WVE8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pacsin2Q9WVE8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pacsin2Q9WVE8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pacsin2Q9WVE8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pacsin2Q9WVE8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pacsin2Q9WVE8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pacsin2Q9WVE8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pacsin2Q9WVE8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pacsin2Q9WVE8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pacsin2Q9WVE8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pacsin2Q9WVE8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pacsin2Q9WVE8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pacsin2Q9WVE8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pacsin2Q9WVE8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pacsin2Q9WVE8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pacsin2Q9WVE8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pacsin2Q9WVE8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pacsin2Q9WVE8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pacsin2Q9WVE8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pacsin2Q9WVE8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pacsin2Q9WVE8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pacsin2Q9WVE8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pacsin2Q9WVE8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pacsin2Q9WVE8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pacsin2Q9WVE8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pacsin2Q9WVE8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pacsin2Q9WVE8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pacsin2Q9WVE8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms