Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srd5a3Q9WUP4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Srd5a3Q9WUP4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Srd5a3Q9WUP4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Srd5a3Q9WUP4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srd5a3Q9WUP4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srd5a3Q9WUP4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Srd5a3Q9WUP4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srd5a3Q9WUP4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srd5a3Q9WUP4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srd5a3Q9WUP4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srd5a3Q9WUP4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srd5a3Q9WUP4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srd5a3Q9WUP4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srd5a3Q9WUP4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srd5a3Q9WUP4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srd5a3Q9WUP4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srd5a3Q9WUP4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srd5a3Q9WUP4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srd5a3Q9WUP4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srd5a3Q9WUP4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srd5a3Q9WUP4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srd5a3Q9WUP4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srd5a3Q9WUP4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srd5a3Q9WUP4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srd5a3Q9WUP4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srd5a3Q9WUP4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srd5a3Q9WUP4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srd5a3Q9WUP4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srd5a3Q9WUP4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srd5a3Q9WUP4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Srd5a3Q9WUP4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srd5a3Q9WUP4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srd5a3Q9WUP4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srd5a3Q9WUP4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srd5a3Q9WUP4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Srd5a3Q9WUP4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srd5a3Q9WUP4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srd5a3Q9WUP4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srd5a3Q9WUP4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srd5a3Q9WUP4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srd5a3Q9WUP4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srd5a3Q9WUP4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srd5a3Q9WUP4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Srd5a3Q9WUP4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Srd5a3Q9WUP4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Srd5a3Q9WUP4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Srd5a3Q9WUP4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Srd5a3Q9WUP4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srd5a3Q9WUP4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srd5a3Q9WUP4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srd5a3Q9WUP4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Srd5a3Q9WUP4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srd5a3Q9WUP4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srd5a3Q9WUP4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srd5a3Q9WUP4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srd5a3Q9WUP4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Srd5a3Q9WUP4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srd5a3Q9WUP4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srd5a3Q9WUP4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srd5a3Q9WUP4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Srd5a3Q9WUP4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srd5a3Q9WUP4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Srd5a3Q9WUP4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srd5a3Q9WUP4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Srd5a3Q9WUP4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srd5a3Q9WUP4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srd5a3Q9WUP4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Srd5a3Q9WUP4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srd5a3Q9WUP4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srd5a3Q9WUP4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srd5a3Q9WUP4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srd5a3Q9WUP4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srd5a3Q9WUP4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srd5a3Q9WUP4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srd5a3Q9WUP4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srd5a3Q9WUP4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srd5a3Q9WUP4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srd5a3Q9WUP4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms