Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUE3

Cyb561d2, Cytochrome b561 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d2Q9WUE3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyb561d2Q9WUE3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyb561d2Q9WUE3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyb561d2Q9WUE3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyb561d2Q9WUE3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyb561d2Q9WUE3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyb561d2Q9WUE3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyb561d2Q9WUE3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyb561d2Q9WUE3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyb561d2Q9WUE3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyb561d2Q9WUE3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyb561d2Q9WUE3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyb561d2Q9WUE3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyb561d2Q9WUE3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyb561d2Q9WUE3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyb561d2Q9WUE3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyb561d2Q9WUE3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyb561d2Q9WUE3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyb561d2Q9WUE3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyb561d2Q9WUE3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyb561d2Q9WUE3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyb561d2Q9WUE3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyb561d2Q9WUE3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyb561d2Q9WUE3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyb561d2Q9WUE3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyb561d2Q9WUE3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyb561d2Q9WUE3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyb561d2Q9WUE3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyb561d2Q9WUE3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyb561d2Q9WUE3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyb561d2Q9WUE3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyb561d2Q9WUE3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyb561d2Q9WUE3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyb561d2Q9WUE3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyb561d2Q9WUE3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyb561d2Q9WUE3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyb561d2Q9WUE3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyb561d2Q9WUE3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyb561d2Q9WUE3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyb561d2Q9WUE3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyb561d2Q9WUE3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyb561d2Q9WUE3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyb561d2Q9WUE3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyb561d2Q9WUE3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyb561d2Q9WUE3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyb561d2Q9WUE3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyb561d2Q9WUE3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyb561d2Q9WUE3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyb561d2Q9WUE3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyb561d2Q9WUE3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyb561d2Q9WUE3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyb561d2Q9WUE3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyb561d2Q9WUE3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyb561d2Q9WUE3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyb561d2Q9WUE3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyb561d2Q9WUE3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyb561d2Q9WUE3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyb561d2Q9WUE3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyb561d2Q9WUE3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyb561d2Q9WUE3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyb561d2Q9WUE3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyb561d2Q9WUE3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cyb561d2Q9WUE3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyb561d2Q9WUE3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyb561d2Q9WUE3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyb561d2Q9WUE3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyb561d2Q9WUE3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyb561d2Q9WUE3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyb561d2Q9WUE3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyb561d2Q9WUE3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyb561d2Q9WUE3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyb561d2Q9WUE3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyb561d2Q9WUE3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyb561d2Q9WUE3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyb561d2Q9WUE3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyb561d2Q9WUE3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyb561d2Q9WUE3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyb561d2Q9WUE3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyb561d2Q9WUE3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyb561d2Q9WUE3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyb561d2Q9WUE3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyb561d2Q9WUE3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyb561d2Q9WUE3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyb561d2Q9WUE3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyb561d2Q9WUE3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyb561d2Q9WUE3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyb561d2Q9WUE3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyb561d2Q9WUE3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyb561d2Q9WUE3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyb561d2Q9WUE3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyb561d2Q9WUE3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyb561d2Q9WUE3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyb561d2Q9WUE3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyb561d2Q9WUE3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyb561d2Q9WUE3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyb561d2Q9WUE3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyb561d2Q9WUE3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyb561d2Q9WUE3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyb561d2Q9WUE3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyb561d2Q9WUE3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms