Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TapbpQ9R233 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TapbpQ9R233 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TapbpQ9R233 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TapbpQ9R233 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TapbpQ9R233 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TapbpQ9R233 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TapbpQ9R233 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TapbpQ9R233 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TapbpQ9R233 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TapbpQ9R233 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TapbpQ9R233 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TapbpQ9R233 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TapbpQ9R233 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TapbpQ9R233 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TapbpQ9R233 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TapbpQ9R233 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TapbpQ9R233 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TapbpQ9R233 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TapbpQ9R233 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TapbpQ9R233 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TapbpQ9R233 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TapbpQ9R233 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TapbpQ9R233 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TapbpQ9R233 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TapbpQ9R233 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TapbpQ9R233 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TapbpQ9R233 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TapbpQ9R233 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TapbpQ9R233 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TapbpQ9R233 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TapbpQ9R233 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TapbpQ9R233 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TapbpQ9R233 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TapbpQ9R233 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TapbpQ9R233 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TapbpQ9R233 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TapbpQ9R233 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TapbpQ9R233 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TapbpQ9R233 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TapbpQ9R233 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TapbpQ9R233 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TapbpQ9R233 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TapbpQ9R233 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TapbpQ9R233 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TapbpQ9R233 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TapbpQ9R233 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TapbpQ9R233 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TapbpQ9R233 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TapbpQ9R233 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TapbpQ9R233 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TapbpQ9R233 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TapbpQ9R233 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TapbpQ9R233 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TapbpQ9R233 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TapbpQ9R233 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TapbpQ9R233 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TapbpQ9R233 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TapbpQ9R233 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TapbpQ9R233 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TapbpQ9R233 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TapbpQ9R233 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TapbpQ9R233 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TapbpQ9R233 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TapbpQ9R233 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TapbpQ9R233 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TapbpQ9R233 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TapbpQ9R233 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TapbpQ9R233 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TapbpQ9R233 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TapbpQ9R233 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TapbpQ9R233 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TapbpQ9R233 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TapbpQ9R233 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TapbpQ9R233 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TapbpQ9R233 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TapbpQ9R233 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TapbpQ9R233 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TapbpQ9R233 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TapbpQ9R233 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TapbpQ9R233 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TapbpQ9R233 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TapbpQ9R233 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TapbpQ9R233 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TapbpQ9R233 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TapbpQ9R233 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TapbpQ9R233 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TapbpQ9R233 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TapbpQ9R233 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TapbpQ9R233 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TapbpQ9R233 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TapbpQ9R233 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TapbpQ9R233 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TapbpQ9R233 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TapbpQ9R233 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TapbpQ9R233 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms