Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ntn3Q9R1A3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ntn3Q9R1A3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ntn3Q9R1A3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ntn3Q9R1A3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ntn3Q9R1A3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ntn3Q9R1A3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ntn3Q9R1A3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ntn3Q9R1A3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ntn3Q9R1A3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ntn3Q9R1A3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ntn3Q9R1A3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ntn3Q9R1A3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ntn3Q9R1A3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ntn3Q9R1A3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ntn3Q9R1A3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ntn3Q9R1A3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ntn3Q9R1A3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ntn3Q9R1A3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ntn3Q9R1A3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ntn3Q9R1A3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ntn3Q9R1A3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ntn3Q9R1A3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ntn3Q9R1A3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ntn3Q9R1A3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ntn3Q9R1A3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ntn3Q9R1A3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ntn3Q9R1A3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ntn3Q9R1A3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ntn3Q9R1A3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ntn3Q9R1A3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ntn3Q9R1A3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ntn3Q9R1A3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ntn3Q9R1A3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ntn3Q9R1A3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ntn3Q9R1A3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ntn3Q9R1A3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ntn3Q9R1A3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ntn3Q9R1A3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ntn3Q9R1A3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ntn3Q9R1A3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ntn3Q9R1A3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ntn3Q9R1A3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ntn3Q9R1A3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ntn3Q9R1A3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ntn3Q9R1A3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ntn3Q9R1A3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ntn3Q9R1A3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ntn3Q9R1A3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ntn3Q9R1A3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ntn3Q9R1A3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ntn3Q9R1A3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ntn3Q9R1A3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ntn3Q9R1A3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ntn3Q9R1A3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ntn3Q9R1A3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ntn3Q9R1A3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ntn3Q9R1A3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ntn3Q9R1A3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ntn3Q9R1A3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ntn3Q9R1A3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ntn3Q9R1A3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ntn3Q9R1A3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ntn3Q9R1A3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ntn3Q9R1A3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ntn3Q9R1A3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ntn3Q9R1A3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ntn3Q9R1A3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ntn3Q9R1A3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ntn3Q9R1A3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ntn3Q9R1A3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ntn3Q9R1A3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ntn3Q9R1A3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ntn3Q9R1A3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ntn3Q9R1A3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ntn3Q9R1A3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ntn3Q9R1A3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ntn3Q9R1A3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ntn3Q9R1A3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ntn3Q9R1A3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ntn3Q9R1A3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ntn3Q9R1A3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ntn3Q9R1A3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ntn3Q9R1A3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ntn3Q9R1A3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ntn3Q9R1A3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ntn3Q9R1A3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ntn3Q9R1A3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ntn3Q9R1A3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ntn3Q9R1A3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ntn3Q9R1A3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ntn3Q9R1A3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ntn3Q9R1A3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ntn3Q9R1A3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ntn3Q9R1A3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ntn3Q9R1A3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ntn3Q9R1A3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ntn3Q9R1A3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ntn3Q9R1A3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ntn3Q9R1A3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms