Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Plod1Q9R0E2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Plod1Q9R0E2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Plod1Q9R0E2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Plod1Q9R0E2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Plod1Q9R0E2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Plod1Q9R0E2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Plod1Q9R0E2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Plod1Q9R0E2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Plod1Q9R0E2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Plod1Q9R0E2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Plod1Q9R0E2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Plod1Q9R0E2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Plod1Q9R0E2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Plod1Q9R0E2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Plod1Q9R0E2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plod1Q9R0E2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Plod1Q9R0E2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Plod1Q9R0E2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Plod1Q9R0E2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Plod1Q9R0E2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Plod1Q9R0E2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Plod1Q9R0E2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Plod1Q9R0E2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Plod1Q9R0E2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Plod1Q9R0E2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Plod1Q9R0E2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Plod1Q9R0E2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Plod1Q9R0E2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Plod1Q9R0E2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Plod1Q9R0E2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Plod1Q9R0E2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Plod1Q9R0E2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Plod1Q9R0E2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Plod1Q9R0E2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Plod1Q9R0E2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Plod1Q9R0E2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Plod1Q9R0E2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Plod1Q9R0E2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Plod1Q9R0E2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Plod1Q9R0E2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Plod1Q9R0E2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Plod1Q9R0E2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Plod1Q9R0E2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Plod1Q9R0E2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Plod1Q9R0E2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Plod1Q9R0E2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plod1Q9R0E2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plod1Q9R0E2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plod1Q9R0E2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plod1Q9R0E2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plod1Q9R0E2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Plod1Q9R0E2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Plod1Q9R0E2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Plod1Q9R0E2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Plod1Q9R0E2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Plod1Q9R0E2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Plod1Q9R0E2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Plod1Q9R0E2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Plod1Q9R0E2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Plod1Q9R0E2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plod1Q9R0E2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plod1Q9R0E2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Plod1Q9R0E2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Plod1Q9R0E2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Plod1Q9R0E2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plod1Q9R0E2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Plod1Q9R0E2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Plod1Q9R0E2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Plod1Q9R0E2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plod1Q9R0E2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plod1Q9R0E2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plod1Q9R0E2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Plod1Q9R0E2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Plod1Q9R0E2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Plod1Q9R0E2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Plod1Q9R0E2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plod1Q9R0E2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plod1Q9R0E2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plod1Q9R0E2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plod1Q9R0E2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plod1Q9R0E2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Plod1Q9R0E2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Plod1Q9R0E2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Plod1Q9R0E2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Plod1Q9R0E2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Plod1Q9R0E2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Plod1Q9R0E2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Plod1Q9R0E2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Plod1Q9R0E2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Plod1Q9R0E2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Plod1Q9R0E2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plod1Q9R0E2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plod1Q9R0E2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plod1Q9R0E2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Plod1Q9R0E2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Plod1Q9R0E2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Plod1Q9R0E2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Plod1Q9R0E2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Plod1Q9R0E2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms