Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CtsfQ9R013 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CtsfQ9R013 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CtsfQ9R013 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CtsfQ9R013 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CtsfQ9R013 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CtsfQ9R013 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CtsfQ9R013 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CtsfQ9R013 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CtsfQ9R013 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CtsfQ9R013 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CtsfQ9R013 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CtsfQ9R013 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CtsfQ9R013 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CtsfQ9R013 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CtsfQ9R013 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CtsfQ9R013 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CtsfQ9R013 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CtsfQ9R013 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CtsfQ9R013 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CtsfQ9R013 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CtsfQ9R013 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CtsfQ9R013 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CtsfQ9R013 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CtsfQ9R013 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CtsfQ9R013 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CtsfQ9R013 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CtsfQ9R013 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CtsfQ9R013 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CtsfQ9R013 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CtsfQ9R013 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CtsfQ9R013 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CtsfQ9R013 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CtsfQ9R013 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CtsfQ9R013 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CtsfQ9R013 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CtsfQ9R013 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CtsfQ9R013 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CtsfQ9R013 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CtsfQ9R013 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CtsfQ9R013 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CtsfQ9R013 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CtsfQ9R013 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CtsfQ9R013 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CtsfQ9R013 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CtsfQ9R013 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CtsfQ9R013 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CtsfQ9R013 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CtsfQ9R013 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CtsfQ9R013 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CtsfQ9R013 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CtsfQ9R013 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CtsfQ9R013 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CtsfQ9R013 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CtsfQ9R013 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CtsfQ9R013 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CtsfQ9R013 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CtsfQ9R013 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CtsfQ9R013 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CtsfQ9R013 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CtsfQ9R013 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CtsfQ9R013 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CtsfQ9R013 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CtsfQ9R013 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CtsfQ9R013 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CtsfQ9R013 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CtsfQ9R013 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CtsfQ9R013 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CtsfQ9R013 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CtsfQ9R013 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CtsfQ9R013 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CtsfQ9R013 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CtsfQ9R013 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CtsfQ9R013 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CtsfQ9R013 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CtsfQ9R013 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CtsfQ9R013 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CtsfQ9R013 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CtsfQ9R013 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CtsfQ9R013 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CtsfQ9R013 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CtsfQ9R013 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CtsfQ9R013 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CtsfQ9R013 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CtsfQ9R013 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CtsfQ9R013 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CtsfQ9R013 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CtsfQ9R013 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CtsfQ9R013 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CtsfQ9R013 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CtsfQ9R013 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CtsfQ9R013 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CtsfQ9R013 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CtsfQ9R013 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CtsfQ9R013 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CtsfQ9R013 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CtsfQ9R013 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CtsfQ9R013 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CtsfQ9R013 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CtsfQ9R013 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms