Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Phtf1Q9QZ09 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Phtf1Q9QZ09 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Phtf1Q9QZ09 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Phtf1Q9QZ09 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Phtf1Q9QZ09 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phtf1Q9QZ09 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phtf1Q9QZ09 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phtf1Q9QZ09 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Phtf1Q9QZ09 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Phtf1Q9QZ09 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Phtf1Q9QZ09 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Phtf1Q9QZ09 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Phtf1Q9QZ09 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Phtf1Q9QZ09 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Phtf1Q9QZ09 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Phtf1Q9QZ09 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Phtf1Q9QZ09 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Phtf1Q9QZ09 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Phtf1Q9QZ09 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Phtf1Q9QZ09 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Phtf1Q9QZ09 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Phtf1Q9QZ09 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Phtf1Q9QZ09 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Phtf1Q9QZ09 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Phtf1Q9QZ09 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Phtf1Q9QZ09 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Phtf1Q9QZ09 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phtf1Q9QZ09 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phtf1Q9QZ09 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phtf1Q9QZ09 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Phtf1Q9QZ09 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Phtf1Q9QZ09 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Phtf1Q9QZ09 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Phtf1Q9QZ09 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Phtf1Q9QZ09 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Phtf1Q9QZ09 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phtf1Q9QZ09 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phtf1Q9QZ09 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Phtf1Q9QZ09 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Phtf1Q9QZ09 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phtf1Q9QZ09 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phtf1Q9QZ09 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phtf1Q9QZ09 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phtf1Q9QZ09 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Phtf1Q9QZ09 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Phtf1Q9QZ09 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Phtf1Q9QZ09 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Phtf1Q9QZ09 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Phtf1Q9QZ09 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Phtf1Q9QZ09 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Phtf1Q9QZ09 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Phtf1Q9QZ09 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Phtf1Q9QZ09 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Phtf1Q9QZ09 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Phtf1Q9QZ09 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Phtf1Q9QZ09 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Phtf1Q9QZ09 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Phtf1Q9QZ09 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Phtf1Q9QZ09 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Phtf1Q9QZ09 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Phtf1Q9QZ09 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Phtf1Q9QZ09 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Phtf1Q9QZ09 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Phtf1Q9QZ09 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Phtf1Q9QZ09 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Phtf1Q9QZ09 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Phtf1Q9QZ09 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Phtf1Q9QZ09 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Phtf1Q9QZ09 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Phtf1Q9QZ09 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Phtf1Q9QZ09 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Phtf1Q9QZ09 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Phtf1Q9QZ09 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Phtf1Q9QZ09 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Phtf1Q9QZ09 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phtf1Q9QZ09 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phtf1Q9QZ09 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Phtf1Q9QZ09 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phtf1Q9QZ09 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phtf1Q9QZ09 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phtf1Q9QZ09 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Phtf1Q9QZ09 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Phtf1Q9QZ09 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Phtf1Q9QZ09 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Phtf1Q9QZ09 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Phtf1Q9QZ09 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Phtf1Q9QZ09 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Phtf1Q9QZ09 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Phtf1Q9QZ09 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Phtf1Q9QZ09 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Phtf1Q9QZ09 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phtf1Q9QZ09 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Phtf1Q9QZ09 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phtf1Q9QZ09 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Phtf1Q9QZ09 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phtf1Q9QZ09 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phtf1Q9QZ09 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phtf1Q9QZ09 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phtf1Q9QZ09 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms