Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdzd4Q9QY39 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdzd4Q9QY39 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdzd4Q9QY39 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdzd4Q9QY39 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdzd4Q9QY39 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdzd4Q9QY39 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Pdzd4Q9QY39 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdzd4Q9QY39 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdzd4Q9QY39 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdzd4Q9QY39 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdzd4Q9QY39 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdzd4Q9QY39 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdzd4Q9QY39 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdzd4Q9QY39 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdzd4Q9QY39 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdzd4Q9QY39 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdzd4Q9QY39 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdzd4Q9QY39 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdzd4Q9QY39 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdzd4Q9QY39 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdzd4Q9QY39 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdzd4Q9QY39 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdzd4Q9QY39 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Pdzd4Q9QY39 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdzd4Q9QY39 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdzd4Q9QY39 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdzd4Q9QY39 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdzd4Q9QY39 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdzd4Q9QY39 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdzd4Q9QY39 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdzd4Q9QY39 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdzd4Q9QY39 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdzd4Q9QY39 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdzd4Q9QY39 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdzd4Q9QY39 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdzd4Q9QY39 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdzd4Q9QY39 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdzd4Q9QY39 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdzd4Q9QY39 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdzd4Q9QY39 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdzd4Q9QY39 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdzd4Q9QY39 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdzd4Q9QY39 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdzd4Q9QY39 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdzd4Q9QY39 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdzd4Q9QY39 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdzd4Q9QY39 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdzd4Q9QY39 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdzd4Q9QY39 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdzd4Q9QY39 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdzd4Q9QY39 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdzd4Q9QY39 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdzd4Q9QY39 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdzd4Q9QY39 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdzd4Q9QY39 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdzd4Q9QY39 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdzd4Q9QY39 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdzd4Q9QY39 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdzd4Q9QY39 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdzd4Q9QY39 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdzd4Q9QY39 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdzd4Q9QY39 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdzd4Q9QY39 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdzd4Q9QY39 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdzd4Q9QY39 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdzd4Q9QY39 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdzd4Q9QY39 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdzd4Q9QY39 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdzd4Q9QY39 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdzd4Q9QY39 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdzd4Q9QY39 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdzd4Q9QY39 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdzd4Q9QY39 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdzd4Q9QY39 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdzd4Q9QY39 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdzd4Q9QY39 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdzd4Q9QY39 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdzd4Q9QY39 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdzd4Q9QY39 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdzd4Q9QY39 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdzd4Q9QY39 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdzd4Q9QY39 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdzd4Q9QY39 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdzd4Q9QY39 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdzd4Q9QY39 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdzd4Q9QY39 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdzd4Q9QY39 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdzd4Q9QY39 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdzd4Q9QY39 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdzd4Q9QY39 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdzd4Q9QY39 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdzd4Q9QY39 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdzd4Q9QY39 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdzd4Q9QY39 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdzd4Q9QY39 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdzd4Q9QY39 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdzd4Q9QY39 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdzd4Q9QY39 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdzd4Q9QY39 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
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