Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cpsf3Q9QXK7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cpsf3Q9QXK7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cpsf3Q9QXK7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cpsf3Q9QXK7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cpsf3Q9QXK7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cpsf3Q9QXK7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cpsf3Q9QXK7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cpsf3Q9QXK7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cpsf3Q9QXK7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cpsf3Q9QXK7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cpsf3Q9QXK7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cpsf3Q9QXK7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cpsf3Q9QXK7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cpsf3Q9QXK7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cpsf3Q9QXK7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cpsf3Q9QXK7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cpsf3Q9QXK7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cpsf3Q9QXK7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cpsf3Q9QXK7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cpsf3Q9QXK7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cpsf3Q9QXK7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cpsf3Q9QXK7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cpsf3Q9QXK7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpsf3Q9QXK7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpsf3Q9QXK7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpsf3Q9QXK7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpsf3Q9QXK7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpsf3Q9QXK7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpsf3Q9QXK7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpsf3Q9QXK7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpsf3Q9QXK7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpsf3Q9QXK7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpsf3Q9QXK7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpsf3Q9QXK7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cpsf3Q9QXK7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cpsf3Q9QXK7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cpsf3Q9QXK7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cpsf3Q9QXK7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cpsf3Q9QXK7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cpsf3Q9QXK7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cpsf3Q9QXK7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cpsf3Q9QXK7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cpsf3Q9QXK7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cpsf3Q9QXK7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpsf3Q9QXK7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpsf3Q9QXK7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cpsf3Q9QXK7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cpsf3Q9QXK7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cpsf3Q9QXK7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cpsf3Q9QXK7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cpsf3Q9QXK7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cpsf3Q9QXK7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cpsf3Q9QXK7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cpsf3Q9QXK7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cpsf3Q9QXK7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cpsf3Q9QXK7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cpsf3Q9QXK7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cpsf3Q9QXK7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpsf3Q9QXK7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpsf3Q9QXK7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpsf3Q9QXK7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpsf3Q9QXK7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpsf3Q9QXK7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpsf3Q9QXK7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpsf3Q9QXK7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpsf3Q9QXK7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpsf3Q9QXK7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpsf3Q9QXK7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cpsf3Q9QXK7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cpsf3Q9QXK7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cpsf3Q9QXK7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cpsf3Q9QXK7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpsf3Q9QXK7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpsf3Q9QXK7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpsf3Q9QXK7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpsf3Q9QXK7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cpsf3Q9QXK7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cpsf3Q9QXK7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cpsf3Q9QXK7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cpsf3Q9QXK7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cpsf3Q9QXK7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpsf3Q9QXK7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpsf3Q9QXK7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpsf3Q9QXK7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpsf3Q9QXK7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpsf3Q9QXK7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpsf3Q9QXK7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpsf3Q9QXK7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpsf3Q9QXK7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpsf3Q9QXK7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpsf3Q9QXK7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpsf3Q9QXK7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpsf3Q9QXK7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cpsf3Q9QXK7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cpsf3Q9QXK7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cpsf3Q9QXK7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cpsf3Q9QXK7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpsf3Q9QXK7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpsf3Q9QXK7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms