Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim44Q9QXA7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim44Q9QXA7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim44Q9QXA7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim44Q9QXA7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim44Q9QXA7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim44Q9QXA7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim44Q9QXA7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim44Q9QXA7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim44Q9QXA7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim44Q9QXA7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim44Q9QXA7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim44Q9QXA7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim44Q9QXA7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim44Q9QXA7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim44Q9QXA7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim44Q9QXA7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim44Q9QXA7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim44Q9QXA7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim44Q9QXA7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim44Q9QXA7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim44Q9QXA7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim44Q9QXA7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Trim44Q9QXA7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim44Q9QXA7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim44Q9QXA7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trim44Q9QXA7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trim44Q9QXA7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trim44Q9QXA7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trim44Q9QXA7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim44Q9QXA7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim44Q9QXA7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim44Q9QXA7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim44Q9QXA7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim44Q9QXA7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trim44Q9QXA7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trim44Q9QXA7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Trim44Q9QXA7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trim44Q9QXA7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim44Q9QXA7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim44Q9QXA7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim44Q9QXA7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim44Q9QXA7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim44Q9QXA7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim44Q9QXA7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim44Q9QXA7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim44Q9QXA7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim44Q9QXA7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim44Q9QXA7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim44Q9QXA7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim44Q9QXA7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim44Q9QXA7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim44Q9QXA7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim44Q9QXA7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim44Q9QXA7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim44Q9QXA7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim44Q9QXA7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim44Q9QXA7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim44Q9QXA7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim44Q9QXA7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim44Q9QXA7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim44Q9QXA7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim44Q9QXA7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim44Q9QXA7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim44Q9QXA7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim44Q9QXA7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim44Q9QXA7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim44Q9QXA7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim44Q9QXA7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim44Q9QXA7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim44Q9QXA7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim44Q9QXA7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim44Q9QXA7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.2 ms