Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rai2Q9QVY8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rai2Q9QVY8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rai2Q9QVY8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rai2Q9QVY8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rai2Q9QVY8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rai2Q9QVY8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rai2Q9QVY8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rai2Q9QVY8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rai2Q9QVY8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rai2Q9QVY8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rai2Q9QVY8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rai2Q9QVY8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rai2Q9QVY8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rai2Q9QVY8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rai2Q9QVY8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rai2Q9QVY8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rai2Q9QVY8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rai2Q9QVY8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rai2Q9QVY8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rai2Q9QVY8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rai2Q9QVY8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rai2Q9QVY8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rai2Q9QVY8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rai2Q9QVY8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rai2Q9QVY8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rai2Q9QVY8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rai2Q9QVY8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rai2Q9QVY8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rai2Q9QVY8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rai2Q9QVY8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rai2Q9QVY8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rai2Q9QVY8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rai2Q9QVY8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rai2Q9QVY8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rai2Q9QVY8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rai2Q9QVY8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rai2Q9QVY8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rai2Q9QVY8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rai2Q9QVY8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rai2Q9QVY8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rai2Q9QVY8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rai2Q9QVY8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rai2Q9QVY8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rai2Q9QVY8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rai2Q9QVY8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rai2Q9QVY8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rai2Q9QVY8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rai2Q9QVY8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rai2Q9QVY8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rai2Q9QVY8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rai2Q9QVY8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rai2Q9QVY8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rai2Q9QVY8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rai2Q9QVY8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rai2Q9QVY8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rai2Q9QVY8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rai2Q9QVY8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rai2Q9QVY8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rai2Q9QVY8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rai2Q9QVY8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rai2Q9QVY8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rai2Q9QVY8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rai2Q9QVY8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rai2Q9QVY8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rai2Q9QVY8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rai2Q9QVY8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rai2Q9QVY8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rai2Q9QVY8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rai2Q9QVY8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rai2Q9QVY8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rai2Q9QVY8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rai2Q9QVY8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rai2Q9QVY8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rai2Q9QVY8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rai2Q9QVY8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rai2Q9QVY8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms