Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psma6Q9QUM9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Psma6Q9QUM9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psma6Q9QUM9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psma6Q9QUM9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psma6Q9QUM9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Psma6Q9QUM9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psma6Q9QUM9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psma6Q9QUM9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psma6Q9QUM9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psma6Q9QUM9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psma6Q9QUM9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psma6Q9QUM9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psma6Q9QUM9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psma6Q9QUM9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psma6Q9QUM9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psma6Q9QUM9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psma6Q9QUM9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psma6Q9QUM9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psma6Q9QUM9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psma6Q9QUM9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psma6Q9QUM9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psma6Q9QUM9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psma6Q9QUM9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psma6Q9QUM9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psma6Q9QUM9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psma6Q9QUM9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Psma6Q9QUM9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psma6Q9QUM9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psma6Q9QUM9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psma6Q9QUM9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psma6Q9QUM9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psma6Q9QUM9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psma6Q9QUM9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psma6Q9QUM9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psma6Q9QUM9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psma6Q9QUM9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psma6Q9QUM9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psma6Q9QUM9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psma6Q9QUM9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psma6Q9QUM9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psma6Q9QUM9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psma6Q9QUM9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psma6Q9QUM9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psma6Q9QUM9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psma6Q9QUM9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psma6Q9QUM9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psma6Q9QUM9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psma6Q9QUM9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psma6Q9QUM9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psma6Q9QUM9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psma6Q9QUM9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psma6Q9QUM9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psma6Q9QUM9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Psma6Q9QUM9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Psma6Q9QUM9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psma6Q9QUM9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psma6Q9QUM9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psma6Q9QUM9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psma6Q9QUM9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psma6Q9QUM9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psma6Q9QUM9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psma6Q9QUM9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psma6Q9QUM9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psma6Q9QUM9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psma6Q9QUM9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psma6Q9QUM9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psma6Q9QUM9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psma6Q9QUM9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psma6Q9QUM9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms