Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkl2Q9QUK0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkl2Q9QUK0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkl2Q9QUK0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkl2Q9QUK0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkl2Q9QUK0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdkl2Q9QUK0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdkl2Q9QUK0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdkl2Q9QUK0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdkl2Q9QUK0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdkl2Q9QUK0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkl2Q9QUK0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkl2Q9QUK0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkl2Q9QUK0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkl2Q9QUK0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkl2Q9QUK0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkl2Q9QUK0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkl2Q9QUK0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdkl2Q9QUK0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdkl2Q9QUK0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdkl2Q9QUK0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkl2Q9QUK0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkl2Q9QUK0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkl2Q9QUK0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkl2Q9QUK0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkl2Q9QUK0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkl2Q9QUK0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkl2Q9QUK0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkl2Q9QUK0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkl2Q9QUK0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkl2Q9QUK0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkl2Q9QUK0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkl2Q9QUK0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkl2Q9QUK0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdkl2Q9QUK0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdkl2Q9QUK0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdkl2Q9QUK0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdkl2Q9QUK0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkl2Q9QUK0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkl2Q9QUK0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkl2Q9QUK0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkl2Q9QUK0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkl2Q9QUK0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkl2Q9QUK0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkl2Q9QUK0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkl2Q9QUK0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkl2Q9QUK0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkl2Q9QUK0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkl2Q9QUK0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkl2Q9QUK0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkl2Q9QUK0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdkl2Q9QUK0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdkl2Q9QUK0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdkl2Q9QUK0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdkl2Q9QUK0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdkl2Q9QUK0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkl2Q9QUK0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkl2Q9QUK0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdkl2Q9QUK0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdkl2Q9QUK0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdkl2Q9QUK0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdkl2Q9QUK0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdkl2Q9QUK0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdkl2Q9QUK0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdkl2Q9QUK0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdkl2Q9QUK0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdkl2Q9QUK0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdkl2Q9QUK0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdkl2Q9QUK0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdkl2Q9QUK0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdkl2Q9QUK0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdkl2Q9QUK0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdkl2Q9QUK0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdkl2Q9QUK0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkl2Q9QUK0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkl2Q9QUK0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkl2Q9QUK0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkl2Q9QUK0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkl2Q9QUK0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkl2Q9QUK0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkl2Q9QUK0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkl2Q9QUK0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkl2Q9QUK0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkl2Q9QUK0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkl2Q9QUK0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkl2Q9QUK0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkl2Q9QUK0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkl2Q9QUK0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkl2Q9QUK0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkl2Q9QUK0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkl2Q9QUK0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkl2Q9QUK0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkl2Q9QUK0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkl2Q9QUK0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkl2Q9QUK0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkl2Q9QUK0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkl2Q9QUK0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkl2Q9QUK0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkl2Q9QUK0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms