Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc2lQ9JME7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc2lQ9JME7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc2lQ9JME7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc2lQ9JME7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc2lQ9JME7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc2lQ9JME7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc2lQ9JME7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc2lQ9JME7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc2lQ9JME7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc2lQ9JME7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc2lQ9JME7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc2lQ9JME7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc2lQ9JME7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc2lQ9JME7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc2lQ9JME7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc2lQ9JME7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc2lQ9JME7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc2lQ9JME7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc2lQ9JME7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trappc2lQ9JME7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc2lQ9JME7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc2lQ9JME7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.1 ms