Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLZ8

Sigirr, Single Ig IL-1-related receptor, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SigirrQ9JLZ8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SigirrQ9JLZ8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SigirrQ9JLZ8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SigirrQ9JLZ8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SigirrQ9JLZ8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SigirrQ9JLZ8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SigirrQ9JLZ8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SigirrQ9JLZ8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SigirrQ9JLZ8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SigirrQ9JLZ8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SigirrQ9JLZ8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SigirrQ9JLZ8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SigirrQ9JLZ8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SigirrQ9JLZ8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SigirrQ9JLZ8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SigirrQ9JLZ8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SigirrQ9JLZ8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SigirrQ9JLZ8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SigirrQ9JLZ8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SigirrQ9JLZ8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SigirrQ9JLZ8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SigirrQ9JLZ8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SigirrQ9JLZ8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SigirrQ9JLZ8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SigirrQ9JLZ8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SigirrQ9JLZ8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SigirrQ9JLZ8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SigirrQ9JLZ8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SigirrQ9JLZ8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SigirrQ9JLZ8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SigirrQ9JLZ8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SigirrQ9JLZ8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SigirrQ9JLZ8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SigirrQ9JLZ8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SigirrQ9JLZ8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SigirrQ9JLZ8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SigirrQ9JLZ8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SigirrQ9JLZ8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SigirrQ9JLZ8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SigirrQ9JLZ8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SigirrQ9JLZ8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SigirrQ9JLZ8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SigirrQ9JLZ8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SigirrQ9JLZ8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SigirrQ9JLZ8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SigirrQ9JLZ8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SigirrQ9JLZ8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SigirrQ9JLZ8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SigirrQ9JLZ8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SigirrQ9JLZ8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SigirrQ9JLZ8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SigirrQ9JLZ8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SigirrQ9JLZ8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SigirrQ9JLZ8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SigirrQ9JLZ8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SigirrQ9JLZ8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SigirrQ9JLZ8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SigirrQ9JLZ8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SigirrQ9JLZ8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SigirrQ9JLZ8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SigirrQ9JLZ8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SigirrQ9JLZ8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SigirrQ9JLZ8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SigirrQ9JLZ8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SigirrQ9JLZ8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SigirrQ9JLZ8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SigirrQ9JLZ8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SigirrQ9JLZ8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SigirrQ9JLZ8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SigirrQ9JLZ8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SigirrQ9JLZ8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SigirrQ9JLZ8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SigirrQ9JLZ8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SigirrQ9JLZ8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SigirrQ9JLZ8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SigirrQ9JLZ8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SigirrQ9JLZ8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SigirrQ9JLZ8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SigirrQ9JLZ8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SigirrQ9JLZ8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SigirrQ9JLZ8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SigirrQ9JLZ8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SigirrQ9JLZ8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SigirrQ9JLZ8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SigirrQ9JLZ8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SigirrQ9JLZ8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SigirrQ9JLZ8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SigirrQ9JLZ8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SigirrQ9JLZ8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SigirrQ9JLZ8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SigirrQ9JLZ8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SigirrQ9JLZ8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SigirrQ9JLZ8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SigirrQ9JLZ8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SigirrQ9JLZ8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SigirrQ9JLZ8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SigirrQ9JLZ8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SigirrQ9JLZ8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SigirrQ9JLZ8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SigirrQ9JLZ8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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