Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC4

Sorcs1, VPS10 domain-containing receptor SorCS1, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorcs1Q9JLC4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sorcs1Q9JLC4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sorcs1Q9JLC4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sorcs1Q9JLC4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sorcs1Q9JLC4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sorcs1Q9JLC4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sorcs1Q9JLC4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sorcs1Q9JLC4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sorcs1Q9JLC4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sorcs1Q9JLC4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sorcs1Q9JLC4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sorcs1Q9JLC4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sorcs1Q9JLC4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sorcs1Q9JLC4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sorcs1Q9JLC4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sorcs1Q9JLC4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sorcs1Q9JLC4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sorcs1Q9JLC4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sorcs1Q9JLC4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sorcs1Q9JLC4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sorcs1Q9JLC4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sorcs1Q9JLC4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sorcs1Q9JLC4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sorcs1Q9JLC4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sorcs1Q9JLC4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sorcs1Q9JLC4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sorcs1Q9JLC4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sorcs1Q9JLC4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sorcs1Q9JLC4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sorcs1Q9JLC4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sorcs1Q9JLC4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sorcs1Q9JLC4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sorcs1Q9JLC4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sorcs1Q9JLC4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sorcs1Q9JLC4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sorcs1Q9JLC4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sorcs1Q9JLC4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sorcs1Q9JLC4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sorcs1Q9JLC4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sorcs1Q9JLC4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sorcs1Q9JLC4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sorcs1Q9JLC4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sorcs1Q9JLC4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sorcs1Q9JLC4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sorcs1Q9JLC4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sorcs1Q9JLC4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sorcs1Q9JLC4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sorcs1Q9JLC4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Sorcs1Q9JLC4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sorcs1Q9JLC4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sorcs1Q9JLC4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sorcs1Q9JLC4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sorcs1Q9JLC4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sorcs1Q9JLC4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sorcs1Q9JLC4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sorcs1Q9JLC4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sorcs1Q9JLC4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sorcs1Q9JLC4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sorcs1Q9JLC4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sorcs1Q9JLC4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sorcs1Q9JLC4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sorcs1Q9JLC4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sorcs1Q9JLC4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sorcs1Q9JLC4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sorcs1Q9JLC4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sorcs1Q9JLC4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sorcs1Q9JLC4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sorcs1Q9JLC4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sorcs1Q9JLC4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sorcs1Q9JLC4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sorcs1Q9JLC4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sorcs1Q9JLC4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sorcs1Q9JLC4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sorcs1Q9JLC4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sorcs1Q9JLC4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sorcs1Q9JLC4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sorcs1Q9JLC4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sorcs1Q9JLC4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sorcs1Q9JLC4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sorcs1Q9JLC4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sorcs1Q9JLC4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sorcs1Q9JLC4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sorcs1Q9JLC4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sorcs1Q9JLC4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sorcs1Q9JLC4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sorcs1Q9JLC4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sorcs1Q9JLC4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sorcs1Q9JLC4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sorcs1Q9JLC4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sorcs1Q9JLC4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sorcs1Q9JLC4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sorcs1Q9JLC4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sorcs1Q9JLC4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sorcs1Q9JLC4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sorcs1Q9JLC4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sorcs1Q9JLC4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sorcs1Q9JLC4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sorcs1Q9JLC4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sorcs1Q9JLC4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sorcs1Q9JLC4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms